Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VEGFCP49767 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms