Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC4A3P48751 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms