Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCP4P48539 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCP4P48539 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCP4P48539 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCP4P48539 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCP4P48539 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCP4P48539 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCP4P48539 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCP4P48539 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms