Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC1P33527 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC1P33527 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC1P33527 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ABCC1P33527 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC1P33527 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC1P33527 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC1P33527 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ABCC1P33527 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC1P33527 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC1P33527 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC1P33527 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC1P33527 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC1P33527 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC1P33527 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC1P33527 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC1P33527 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC1P33527 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC1P33527 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC1P33527 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ABCC1P33527 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC1P33527 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC1P33527 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC1P33527 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC1P33527 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC1P33527 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC1P33527 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC1P33527 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC1P33527 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC1P33527 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC1P33527 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC1P33527 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC1P33527 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC1P33527 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC1P33527 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC1P33527 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC1P33527 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC1P33527 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC1P33527 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.1 ms