Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXP28300 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXP28300 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXP28300 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXP28300 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXP28300 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXP28300 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXP28300 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXP28300 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXP28300 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXP28300 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXP28300 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXP28300 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXP28300 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXP28300 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXP28300 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXP28300 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXP28300 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXP28300 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXP28300 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXP28300 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXP28300 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXP28300 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LOXP28300 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LOXP28300 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LOXP28300 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LOXP28300 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LOXP28300 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LOXP28300 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXP28300 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXP28300 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXP28300 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXP28300 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXP28300 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXP28300 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXP28300 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXP28300 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXP28300 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXP28300 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXP28300 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXP28300 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXP28300 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXP28300 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXP28300 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXP28300 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXP28300 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXP28300 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXP28300 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXP28300 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXP28300 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXP28300 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXP28300 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXP28300 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXP28300 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXP28300 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXP28300 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXP28300 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXP28300 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXP28300 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXP28300 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXP28300 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXP28300 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXP28300 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXP28300 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXP28300 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXP28300 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXP28300 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXP28300 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms