Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC00271P0C7V0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms