Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP3P08254 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP3P08254 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP3P08254 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP3P08254 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP3P08254 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP3P08254 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP3P08254 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP3P08254 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP3P08254 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP3P08254 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP3P08254 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP3P08254 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP3P08254 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP3P08254 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP3P08254 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP3P08254 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP3P08254 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP3P08254 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP3P08254 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP3P08254 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP3P08254 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP3P08254 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP3P08254 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP3P08254 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP3P08254 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP3P08254 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP3P08254 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP3P08254 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP3P08254 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP3P08254 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP3P08254 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP3P08254 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP3P08254 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP3P08254 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP3P08254 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP3P08254 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP3P08254 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP3P08254 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP3P08254 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP3P08254 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP3P08254 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP3P08254 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP3P08254 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP3P08254 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP3P08254 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP3P08254 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP3P08254 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP3P08254 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP3P08254 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP3P08254 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP3P08254 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP3P08254 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP3P08254 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP3P08254 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP3P08254 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP3P08254 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP3P08254 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP3P08254 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP3P08254 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP3P08254 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.3 ms