Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOCP08134 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOCP08134 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOCP08134 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOCP08134 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOCP08134 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOCP08134 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOCP08134 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOCP08134 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOCP08134 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOCP08134 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOCP08134 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOCP08134 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOCP08134 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOCP08134 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOCP08134 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOCP08134 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOCP08134 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOCP08134 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOCP08134 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOCP08134 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOCP08134 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOCP08134 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOCP08134 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOCP08134 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOCP08134 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOCP08134 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOCP08134 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOCP08134 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOCP08134 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOCP08134 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOCP08134 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOCP08134 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOCP08134 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOCP08134 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOCP08134 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOCP08134 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOCP08134 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOCP08134 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOCP08134 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOCP08134 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOCP08134 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOCP08134 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOCP08134 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOCP08134 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOCP08134 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOCP08134 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOCP08134 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOCP08134 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOCP08134 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOCP08134 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOCP08134 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOCP08134 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOCP08134 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOCP08134 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOCP08134 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOCP08134 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOCP08134 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOCP08134 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOCP08134 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOCP08134 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOCP08134 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOCP08134 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOCP08134 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOCP08134 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOCP08134 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOCP08134 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOCP08134 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOCP08134 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOCP08134 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOCP08134 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOCP08134 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOCP08134 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOCP08134 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOCP08134 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOCP08134 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOCP08134 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOCP08134 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOCP08134 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOCP08134 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOCP08134 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOCP08134 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOCP08134 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOCP08134 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.8 ms