Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCP110O43303 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCP110O43303 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCP110O43303 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCP110O43303 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCP110O43303 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCP110O43303 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCP110O43303 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCP110O43303 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCP110O43303 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCP110O43303 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCP110O43303 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCP110O43303 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCP110O43303 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCP110O43303 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCP110O43303 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCP110O43303 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCP110O43303 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCP110O43303 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCP110O43303 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCP110O43303 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCP110O43303 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCP110O43303 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCP110O43303 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCP110O43303 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCP110O43303 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCP110O43303 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCP110O43303 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCP110O43303 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCP110O43303 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCP110O43303 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCP110O43303 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCP110O43303 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCP110O43303 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCP110O43303 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCP110O43303 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCP110O43303 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCP110O43303 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCP110O43303 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCP110O43303 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCP110O43303 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCP110O43303 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCP110O43303 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCP110O43303 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCP110O43303 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCP110O43303 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCP110O43303 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCP110O43303 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCP110O43303 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCP110O43303 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCP110O43303 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCP110O43303 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCP110O43303 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCP110O43303 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCP110O43303 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCP110O43303 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCP110O43303 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCP110O43303 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCP110O43303 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCP110O43303 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCP110O43303 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCP110O43303 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCP110O43303 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCP110O43303 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCP110O43303 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCP110O43303 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCP110O43303 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCP110O43303 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCP110O43303 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCP110O43303 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCP110O43303 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCP110O43303 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCP110O43303 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCP110O43303 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCP110O43303 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCP110O43303 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCP110O43303 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCP110O43303 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCP110O43303 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCP110O43303 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCP110O43303 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCP110O43303 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCP110O43303 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCP110O43303 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms