Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACOX3O15254 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms