Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms