Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMCO3A2RU48 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms