Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOX13Q9UN79 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX13Q9UN79 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX13Q9UN79 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms