Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NECAP2Q9NVZ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms