Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SARS2Q9NP81 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SARS2Q9NP81 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARS2Q9NP81 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms