Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TSEN34Q9BSV6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSEN34Q9BSV6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms