Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS25Q9BRG1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms