Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E2Q96LR5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E2Q96LR5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms