Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGBD1Q96JS3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGBD1Q96JS3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms