Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS50Q96JG6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms