Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF6Q96J87 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms