Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH5

SOCS4, Suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4Q8WXH5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOCS4Q8WXH5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms