Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP33Q8TEY7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms