Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RP9Q8TA86 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
RP9Q8TA86 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RP9Q8TA86 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RP9Q8TA86 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RP9Q8TA86 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RP9Q8TA86 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RP9Q8TA86 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RP9Q8TA86 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RP9Q8TA86 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RP9Q8TA86 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RP9Q8TA86 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RP9Q8TA86 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RP9Q8TA86 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RP9Q8TA86 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RP9Q8TA86 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RP9Q8TA86 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RP9Q8TA86 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RP9Q8TA86 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RP9Q8TA86 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RP9Q8TA86 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RP9Q8TA86 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RP9Q8TA86 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RP9Q8TA86 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RP9Q8TA86 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RP9Q8TA86 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RP9Q8TA86 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RP9Q8TA86 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RP9Q8TA86 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RP9Q8TA86 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RP9Q8TA86 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RP9Q8TA86 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RP9Q8TA86 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RP9Q8TA86 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RP9Q8TA86 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RP9Q8TA86 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RP9Q8TA86 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RP9Q8TA86 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RP9Q8TA86 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RP9Q8TA86 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RP9Q8TA86 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms