Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC82Q8N4S0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms