Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP9Q8IXQ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP9Q8IXQ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms