Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC83Q8IWF9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC83Q8IWF9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms