Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM139Q8IV31 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms