Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SOHLH1Q5JUK2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOHLH1Q5JUK2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms