Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNI3KQ59H18 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI3KQ59H18 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms