Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ME3Q16798 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ME3Q16798 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ME3Q16798 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME3Q16798 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME3Q16798 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME3Q16798 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME3Q16798 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME3Q16798 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME3Q16798 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME3Q16798 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ME3Q16798 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME3Q16798 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME3Q16798 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME3Q16798 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME3Q16798 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME3Q16798 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME3Q16798 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME3Q16798 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME3Q16798 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME3Q16798 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME3Q16798 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME3Q16798 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME3Q16798 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME3Q16798 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME3Q16798 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ME3Q16798 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ME3Q16798 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME3Q16798 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME3Q16798 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME3Q16798 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME3Q16798 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME3Q16798 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME3Q16798 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ME3Q16798 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ME3Q16798 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ME3Q16798 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ME3Q16798 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ME3Q16798 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ME3Q16798 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ME3Q16798 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ME3Q16798 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ME3Q16798 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ME3Q16798 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
ME3Q16798 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ME3Q16798 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME3Q16798 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME3Q16798 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME3Q16798 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME3Q16798 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME3Q16798 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME3Q16798 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME3Q16798 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME3Q16798 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME3Q16798 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME3Q16798 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ME3Q16798 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME3Q16798 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ME3Q16798 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME3Q16798 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ME3Q16798 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME3Q16798 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME3Q16798 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ME3Q16798 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME3Q16798 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME3Q16798 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME3Q16798 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME3Q16798 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME3Q16798 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME3Q16798 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME3Q16798 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME3Q16798 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME3Q16798 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME3Q16798 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ME3Q16798 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME3Q16798 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME3Q16798 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ME3Q16798 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME3Q16798 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME3Q16798 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ME3Q16798 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME3Q16798 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME3Q16798 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ME3Q16798 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ME3Q16798 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
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