Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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