Protein–RNA interactions for Protein: Q14999

CUL7, Cullin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL7Q14999 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CUL7Q14999 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CUL7Q14999 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CUL7Q14999 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUL7Q14999 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms