Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH18Q13634 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
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