Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRPS35P82673 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPS35P82673 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms