Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REG1BP48304 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REG1BP48304 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REG1BP48304 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REG1BP48304 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REG1BP48304 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
REG1BP48304 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG1BP48304 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REG1BP48304 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REG1BP48304 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REG1BP48304 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REG1BP48304 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REG1BP48304 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REG1BP48304 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REG1BP48304 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REG1BP48304 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REG1BP48304 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REG1BP48304 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG1BP48304 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG1BP48304 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG1BP48304 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG1BP48304 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG1BP48304 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG1BP48304 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
REG1BP48304 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG1BP48304 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG1BP48304 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG1BP48304 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG1BP48304 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
REG1BP48304 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG1BP48304 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG1BP48304 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG1BP48304 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG1BP48304 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG1BP48304 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG1BP48304 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
REG1BP48304 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG1BP48304 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
REG1BP48304 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG1BP48304 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG1BP48304 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG1BP48304 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG1BP48304 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REG1BP48304 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REG1BP48304 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
REG1BP48304 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
REG1BP48304 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
REG1BP48304 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REG1BP48304 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REG1BP48304 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
REG1BP48304 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REG1BP48304 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REG1BP48304 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REG1BP48304 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REG1BP48304 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REG1BP48304 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REG1BP48304 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REG1BP48304 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms