Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARSP41250 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARSP41250 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARSP41250 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARSP41250 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARSP41250 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARSP41250 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARSP41250 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARSP41250 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARSP41250 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARSP41250 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARSP41250 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARSP41250 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARSP41250 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARSP41250 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARSP41250 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARSP41250 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARSP41250 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARSP41250 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GARSP41250 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARSP41250 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARSP41250 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARSP41250 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GARSP41250 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GARSP41250 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GARSP41250 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GARSP41250 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GARSP41250 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GARSP41250 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GARSP41250 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARSP41250 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GARSP41250 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GARSP41250 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GARSP41250 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GARSP41250 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GARSP41250 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GARSP41250 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GARSP41250 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GARSP41250 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GARSP41250 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GARSP41250 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GARSP41250 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GARSP41250 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GARSP41250 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARSP41250 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARSP41250 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARSP41250 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARSP41250 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARSP41250 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARSP41250 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARSP41250 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARSP41250 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARSP41250 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARSP41250 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms