Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ABCC1P33527 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC1P33527 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ABCC1P33527 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC1P33527 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC1P33527 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC1P33527 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC1P33527 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC1P33527 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC1P33527 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC1P33527 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC1P33527 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC1P33527 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC1P33527 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC1P33527 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC1P33527 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC1P33527 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms