Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFD1P11586 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms