Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 04e-6■■■■■ 35.5
DKC1O60832 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.062e-23■■■■■ 35.5
DKC1O60832 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-23■■■■■ 35.5
DKC1O60832 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 510.67□□□□□ -0.75e-48■■■■■ 35.5
DKC1O60832 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 29.29□□□□□ -0.925e-48■■■■■ 35.5
DKC1O60832 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 29.16□□□□□ -0.945e-48■■■■■ 35.5
DKC1O60832 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 38.12□□□□□ -1.115e-48■■■■■ 35.5
DKC1O60832 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 35.4
DKC1O60832 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.699e-8■■■■■ 35.4
DKC1O60832 HNF1A-203ENST00000402929 3002 ntTSL 216.73■□□□□ 0.279e-8■■■■■ 35.4
DKC1O60832 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 315.25■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 35.4
DKC1O60832 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-10■■■■■ 35.4
DKC1O60832 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.373e-10■■■■■ 35.4
DKC1O60832 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.423e-13■■■■■ 35.3
DKC1O60832 ATL2-213ENST00000474535 597 ntTSL 33.31□□□□□ -1.883e-6■■■■■ 35.2
DKC1O60832 PATJ-215ENST00000635137 2298 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 35.2
DKC1O60832 PATJ-201ENST00000307297 1585 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 35.2
DKC1O60832 PATJ-207ENST00000484562 5448 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 35.2
DKC1O60832 PATJ-214ENST00000635023 5242 ntTSL 510.53□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 35.2
DKC1O60832 PATJ-208ENST00000484937 4990 ntTSL 510.11□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 35.2
DKC1O60832 PATJ-216ENST00000635214 4863 ntTSL 1 (best)9.55□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 35.2
DKC1O60832 PATJ-204ENST00000459752 5349 ntTSL 1 (best)9.5□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 35.2
DKC1O60832 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 35.2
DKC1O60832 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 35.2
DKC1O60832 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 35.2
DKC1O60832 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 35.2
DKC1O60832 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 35.2
DKC1O60832 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 35.2
DKC1O60832 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 35.2
DKC1O60832 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 35.2
DKC1O60832 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.264e-10■■■■■ 35.2
DKC1O60832 SLC25A42-204ENST00000597661 519 ntTSL 318.02■□□□□ 0.484e-10■■■■■ 35.2
DKC1O60832 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 213.32□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 35.1
DKC1O60832 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.629e-9■■■■■ 35
DKC1O60832 RPS6KA2-207ENST00000506565 587 ntTSL 414.36□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 35
DKC1O60832 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 35
DKC1O60832 RPS6KA2-206ENST00000503859 4137 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 35
DKC1O60832 RPS6KA2-213ENST00000512860 552 ntTSL 48.69□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 35
DKC1O60832 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 513.32□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 34.7
DKC1O60832 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)12.21□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 34.7
DKC1O60832 RALB-207ENST00000470417 1931 ntTSL 327.43■■□□□ 1.986e-10■■■■■ 34.7
DKC1O60832 RALB-204ENST00000431732 767 ntTSL 525.34■■□□□ 1.656e-10■■■■■ 34.7
DKC1O60832 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.626e-10■■■■■ 34.7
DKC1O60832 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.576e-10■■■■■ 34.7
DKC1O60832 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.456e-10■■■■■ 34.7
DKC1O60832 RALB-206ENST00000449649 667 ntTSL 518.92■□□□□ 0.626e-10■■■■■ 34.7
DKC1O60832 RALB-202ENST00000412383 981 ntTSL 318.43■□□□□ 0.546e-10■■■■■ 34.7
DKC1O60832 RALB-205ENST00000447591 558 ntTSL 414.62□□□□□ -0.076e-10■■■■■ 34.7
DKC1O60832 GAK-211ENST00000509566 3126 ntTSL 216.06■□□□□ 0.168e-7■■■■■ 34.6
DKC1O60832 PYCR3-206ENST00000482616 830 ntTSL 224.98■■□□□ 1.594e-9■■■■■ 34.6
DKC1O60832 PYCR3-204ENST00000447926 1324 ntTSL 224.96■■□□□ 1.594e-9■■■■■ 34.6
DKC1O60832 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.424e-9■■■■■ 34.6
DKC1O60832 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.24e-9■■■■■ 34.6
DKC1O60832 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.114e-9■■■■■ 34.6
DKC1O60832 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.444e-9■■■■■ 34.6
DKC1O60832 PYCR3-205ENST00000462036 579 ntTSL 415.24■□□□□ 0.034e-9■■■■■ 34.6
DKC1O60832 KIAA0907-207ENST00000478002 1065 ntTSL 57□□□□□ -1.291e-323■■■■■ 34.6
DKC1O60832 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.011e-323■■■■■ 34.6
DKC1O60832 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 34.5
DKC1O60832 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 34.5
DKC1O60832 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 34.5
DKC1O60832 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 34.5
DKC1O60832 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 34.5
DKC1O60832 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 34.5
DKC1O60832 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 34.5
DKC1O60832 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.754e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.724e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.644e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.454e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.454e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.454e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.084e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.174e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-215ENST00000630056 1999 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.354e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-214ENST00000628216 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.434e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-207ENST00000425686 637 ntTSL 311.55□□□□□ -0.564e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-213ENST00000626025 616 ntTSL 511.43□□□□□ -0.584e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-208ENST00000434018 523 ntTSL 310.43□□□□□ -0.744e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-202ENST00000360010 481 ntTSL 59.48□□□□□ -0.894e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ZNF133-209ENST00000462170 4060 ntTSL 28.35□□□□□ -1.074e-14■■■■■ 34.4
DKC1O60832 LRMDA-209ENST00000593699 1124 ntTSL 1 (best)12.35□□□□□ -0.435e-9■■■■■ 34.4
DKC1O60832 LRMDA-210ENST00000593817 221 ntTSL 35.57□□□□□ -1.525e-9■■■■■ 34.4
DKC1O60832 CRYBB2P1-201ENST00000354451 1560 ntTSL 1 (best)14.77□□□□□ -0.056e-8■■■■■ 34.4
DKC1O60832 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ODC1-204ENST00000446285 665 ntTSL 530.01■■■□□ 2.391e-323■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.161e-323■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.131e-323■■■■■ 34.4
DKC1O60832 ODC1-203ENST00000443218 494 ntTSL 218.17■□□□□ 0.51e-323■■■■■ 34.4
DKC1O60832 SNORA80B-201ENST00000383906 136 ntBASIC13.21□□□□□ -0.291e-323■■■■■ 34.4
DKC1O60832 SNHG11-211ENST00000444816 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-323■■■■■ 34.4
DKC1O60832 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.661e-323■■■■■ 34.4
DKC1O60832 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 34.4
DKC1O60832 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.913e-9■■■■■ 34.4
DKC1O60832 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -13e-9■■■■■ 34.4
DKC1O60832 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.511e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 ANKHD1-220ENST00000511151 1216 ntTSL 324.31■■□□□ 1.481e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.381e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.381e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 34.3
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