RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443218.1

ODC1-203, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ODC1, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-203ENST00000443218 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.78■■■■■ 4.28
ODC1-203ENST00000443218 ABCC9O60706 1549 aa38.02■■■■□ 3.68
ODC1-203ENST00000443218 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.61■■■■□ 3.61
ODC1-203ENST00000443218 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.1■■■■□ 3.37
ODC1-203ENST00000443218 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.95■■■■□ 3.35
ODC1-203ENST00000443218 NACADO15069 1562 aa35.63■■■■□ 3.29
ODC1-203ENST00000443218 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.35■■■■□ 3.25
ODC1-203ENST00000443218 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.35■■■■□ 3.25
ODC1-203ENST00000443218 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.26■■■■□ 3.23
ODC1-203ENST00000443218 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.05■■■■□ 3.2
ODC1-203ENST00000443218 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.02■■■■□ 3.2
ODC1-203ENST00000443218 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
ODC1-203ENST00000443218 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.45■■■■□ 3.11
ODC1-203ENST00000443218 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.39■■■■□ 3.1
ODC1-203ENST00000443218 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.33■■■■□ 3.09
ODC1-203ENST00000443218 SCRIBQ14160 1630 aa34.29■■■■□ 3.08
ODC1-203ENST00000443218 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.26■■■■□ 3.07
ODC1-203ENST00000443218 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
ODC1-203ENST00000443218 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.31■■■□□ 2.92
ODC1-203ENST00000443218 NCAPD3P42695 1498 aa32.94■■■□□ 2.86
ODC1-203ENST00000443218 CUX2O14529 1486 aa32.85■■■□□ 2.85
ODC1-203ENST00000443218 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.8■■■□□ 2.84
ODC1-203ENST00000443218 ERCC6Q03468 1493 aa32.75■■■□□ 2.83
ODC1-203ENST00000443218 SMARCA4P51532 1647 aa32.66■■■□□ 2.82
ODC1-203ENST00000443218 HMGXB3Q12766 1538 aa32.63■■■□□ 2.81
ODC1-203ENST00000443218 SMARCA2P51531 1590 aa32.62■■■□□ 2.81
ODC1-203ENST00000443218 NESP48681 1621 aa32.6■■■□□ 2.81
ODC1-203ENST00000443218 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
ODC1-203ENST00000443218 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
ODC1-203ENST00000443218 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.36■■■□□ 2.77
ODC1-203ENST00000443218 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
ODC1-203ENST00000443218 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.24■■■□□ 2.75
ODC1-203ENST00000443218 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.21■■■□□ 2.75
ODC1-203ENST00000443218 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.14■■■□□ 2.74
ODC1-203ENST00000443218 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32■■■□□ 2.71
ODC1-203ENST00000443218 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.9■■■□□ 2.7
ODC1-203ENST00000443218 WIZO95785 1651 aa31.83■■■□□ 2.69
ODC1-203ENST00000443218 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.8■■■□□ 2.68
ODC1-203ENST00000443218 WDR62O43379 1518 aa31.76■■■□□ 2.68
ODC1-203ENST00000443218 TRIM41Q8WV44 630 aa31.65■■■□□ 2.66
ODC1-203ENST00000443218 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.59■■■□□ 2.65
ODC1-203ENST00000443218 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.54■■■□□ 2.64
ODC1-203ENST00000443218 CFTRP13569 1480 aa31.48■■■□□ 2.63
ODC1-203ENST00000443218 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
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ODC1-203ENST00000443218 OSCARQ8IYS5 282 aa31.28■■■□□ 2.6
ODC1-203ENST00000443218 PRDM2Q13029 1718 aa31.1■■■□□ 2.57
ODC1-203ENST00000443218 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
ODC1-203ENST00000443218 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.02■■■□□ 2.56
ODC1-203ENST00000443218 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.99■■■□□ 2.55
ODC1-203ENST00000443218 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.99■■■□□ 2.55
ODC1-203ENST00000443218 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.99■■■□□ 2.55
ODC1-203ENST00000443218 IFT140Q96RY7 1462 aa30.96■■■□□ 2.55
ODC1-203ENST00000443218 TOPBP1Q92547 1522 aa30.93■■■□□ 2.54
ODC1-203ENST00000443218 ARHGEF11O15085 1522 aa30.84■■■□□ 2.53
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ODC1-203ENST00000443218 ABCC8Q09428 1581 aa30.74■■■□□ 2.51
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ODC1-203ENST00000443218 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.61■■■□□ 2.49
ODC1-203ENST00000443218 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
ODC1-203ENST00000443218 ARAP1Q96P48 1450 aa30.54■■■□□ 2.48
ODC1-203ENST00000443218 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.51■■■□□ 2.48
ODC1-203ENST00000443218 FBLN2P98095 1184 aa30.47■■■□□ 2.47
ODC1-203ENST00000443218 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
ODC1-203ENST00000443218 SOGA1O94964 1423 aa30.41■■■□□ 2.46
ODC1-203ENST00000443218 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.35■■■□□ 2.45
ODC1-203ENST00000443218 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.34■■■□□ 2.45
ODC1-203ENST00000443218 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
ODC1-203ENST00000443218 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.32■■■□□ 2.44
ODC1-203ENST00000443218 CUX1P39880 1505 aa30.3■■■□□ 2.44
ODC1-203ENST00000443218 WDR97A6NE52 1622 aa30.26■■■□□ 2.44
ODC1-203ENST00000443218 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
ODC1-203ENST00000443218 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
ODC1-203ENST00000443218 SYNJ1O43426 1573 aa30.18■■■□□ 2.42
ODC1-203ENST00000443218 GRIN2BQ13224 1484 aa30.17■■■□□ 2.42
ODC1-203ENST00000443218 SYNJ2O15056 1496 aa30.12■■■□□ 2.41
ODC1-203ENST00000443218 PBRM1Q86U86 1689 aa30.07■■■□□ 2.4
ODC1-203ENST00000443218 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.03■■■□□ 2.4
ODC1-203ENST00000443218 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.98■■■□□ 2.39
ODC1-203ENST00000443218 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.96■■■□□ 2.39
ODC1-203ENST00000443218 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.88■■■□□ 2.37
ODC1-203ENST00000443218 GRIN2AQ12879 1464 aa29.81■■■□□ 2.36
ODC1-203ENST00000443218 ADAMTS12P58397 1594 aa29.77■■■□□ 2.36
ODC1-203ENST00000443218 CEP170Q5SW79 1584 aa29.77■■■□□ 2.36
ODC1-203ENST00000443218 NUP160Q12769 1436 aa29.75■■■□□ 2.35
ODC1-203ENST00000443218 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
ODC1-203ENST00000443218 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.68■■■□□ 2.34
ODC1-203ENST00000443218 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
ODC1-203ENST00000443218 SHROOM2Q13796 1616 aa29.67■■■□□ 2.34
ODC1-203ENST00000443218 TOP2BQ02880 1626 aa29.66■■■□□ 2.34
ODC1-203ENST00000443218 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
ODC1-203ENST00000443218 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.62■■■□□ 2.33
ODC1-203ENST00000443218 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.55■■■□□ 2.32
ODC1-203ENST00000443218 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.48■■■□□ 2.31
ODC1-203ENST00000443218 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
ODC1-203ENST00000443218 JPH4Q96JJ6 628 aa29.4■■■□□ 2.3
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