Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACOX3O15254 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms