Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DFFAO00273 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DFFAO00273 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DFFAO00273 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DFFAO00273 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DFFAO00273 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DFFAO00273 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DFFAO00273 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DFFAO00273 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DFFAO00273 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DFFAO00273 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DFFAO00273 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DFFAO00273 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DFFAO00273 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DFFAO00273 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DFFAO00273 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DFFAO00273 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DFFAO00273 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DFFAO00273 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DFFAO00273 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DFFAO00273 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DFFAO00273 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DFFAO00273 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DFFAO00273 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DFFAO00273 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DFFAO00273 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DFFAO00273 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DFFAO00273 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DFFAO00273 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DFFAO00273 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DFFAO00273 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DFFAO00273 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DFFAO00273 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DFFAO00273 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DFFAO00273 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DFFAO00273 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DFFAO00273 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DFFAO00273 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DFFAO00273 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DFFAO00273 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DFFAO00273 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DFFAO00273 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DFFAO00273 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFAO00273 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFAO00273 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFAO00273 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFAO00273 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFAO00273 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFAO00273 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFAO00273 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFAO00273 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFAO00273 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFAO00273 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFAO00273 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFAO00273 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFAO00273 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFAO00273 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFAO00273 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFAO00273 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFAO00273 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFAO00273 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFAO00273 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFAO00273 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFAO00273 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFAO00273 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFAO00273 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFAO00273 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DFFAO00273 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DFFAO00273 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DFFAO00273 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DFFAO00273 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DFFAO00273 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DFFAO00273 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DFFAO00273 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DFFAO00273 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DFFAO00273 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DFFAO00273 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFAO00273 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFAO00273 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFAO00273 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFAO00273 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFAO00273 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFAO00273 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFAO00273 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFAO00273 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFAO00273 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DFFAO00273 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DFFAO00273 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DFFAO00273 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DFFAO00273 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DFFAO00273 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DFFAO00273 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DFFAO00273 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms