Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN7Q9Y6W3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN7Q9Y6W3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms