Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX13Q9Y5W8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX13Q9Y5W8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms