Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD3Q9Y597 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD3Q9Y597 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms