Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
FOXD3Q9UJU5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms