Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCIQ9NVI1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCIQ9NVI1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCIQ9NVI1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.8 ms