Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM100Q9NV29 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms