Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF6Q96J87 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CELF6Q96J87 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.4 ms